O jogo de proteínas: Foldit

Proteínas

Informações sobre proteína e alimentos ricos em proteína

Jogo de Puzzle das proteínas

O conceito do jogo multiplayer online traz à mente jogos como World of Warcraft e Ultima. A Howard Hughes Medical Institute ( HHMI) da Universidade de Washington apresenta a criação de proteínas nesta linha de jogos com o lançamento do Foldit, um jogo livre em que jogadores de todo o mundo competem às proteínas do projeto.

O benefício mundo real: proteínas Cientistas teste projetados por jogadores do jogo para ver se eles poderiam ser compostos viáveis para novos medicamentos. Assim, em todo o mundo os jogadores podem ajudar na investigação de doenças como a SIDA, o cancro ou a doença de Alzheimer.

O desenvolvimento do jogo on-line é uma extensão natural do HHMI pesquisa investigador David Baker, para entender proteínas. Durante a última década, Baker e seus colegas têm feito um progresso constante no desenvolvimento de algoritmos de computador para prever como uma cadeia linear de aminoácidos irá dobrar na forma característica de uma determinada proteína.

Uma compreensão detalhada da estrutura de uma proteína pode fornecer uma grande quantidade de informação científica complexidades revelar a função biológica das proteínas e sugerir novas ideias para a concepção de medicamentos.

Como o jogo de proteínas

Foldit proteína -criação -

A previsão das formas que levem proteínas naturais é um dos desafios atuais em biologia, e até mesmo uma modelagem pequena proteína requer a execução de trilhões de cálculos. Nos últimos três anos, voluntários de todo o mundo, atualmente cerca de 200 mil, doaram parte de seu tempo de computador para realizar estes cálculos em uma rede distribuída chamado Rosetta. A lógica por trás da rede é um algoritmo chamado Rosetta, que utiliza a técnica de Monte Carlo para encontrar o melhor ajuste para todas as partes de uma determinada proteína.

Mas como o Rosetta voluntários assistiram seus computadores cegamente tentando encontrar uma solução metodicamente testar todas as combinações possíveis e como obter o melhor ajuste, começou a pensar que uma pequena intervenção humana pode acelerar as coisas.

Baker não sabia como eu poderia fazer isso até que um par de anos, quando eu estava caminhando no Monte Rainier com seu vizinho David Salesin, da Universidade de Washington cientista da computação que também tem um laboratório de pesquisa nas proximidades da Adobe Systems. Baker e Salesin começou a discutir maneiras de fazer Rosetta mais interativo. Salesin achei um jogo multiplayer online foi o caminho a percorrer. Salesin Baker deu os nomes de três colegas, liderados pelo cientista da computação UW Zoran Popovic, Baker poderia ajudar a criar o jogo.

Durante os meses seguintes, o estudante de doutorado Seth Cooper, Adrien, e pesquisador pós-doutorado Treuille, trabalhando com Popovic e Baker, criou o programa ea equipe testaram em pequena escala. Um jogo entre equipas da Universidade da Califórnia e da Universidade de Illinois despertou fervor inesperado e aplaudindo na platéia. 30 ou 40 pessoas participaram, diz Baker. A competição foi muito intenso.

Foldit leva os jogadores através de uma série de níveis de prática destinados a ensinar os fundamentos do dobramento de proteínas, antes de virar -los soltos em proteínas reais da natureza. Nosso principal objetivo era garantir que qualquer um poderia fazer isso, mas não sabia o que bioquímica ou dobra de proteínas, Popovic disse.

Os objetivos do jogo de proteínas

Foldit -jogo- torneio de proteína

Baker tem esperanças de que a velocidade do jogo para cima, de previsão de estrutura, às vezes chato. Novas proteínas pode ser útil em muitas aplicações, de produtos farmacêuticos e produtos químicos industriais, para limpar a poluição. Com a capacidade de qualquer um com um computador e uma ligação à Internet para começar construir proteínas, Baker acredita que o ritmo de descoberta pode subir rapidamente. Meu sonho é que um 12-year -Indonésia passa a ser um prodígio e construir uma cura para o HIV, diz.

Baixe o jogo das proteínas

Os usuários podem acessar o jogo via web em www.fold.it. O jogo está disponível em versões para Windows, Mac e Linux.

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