Como nas outras fases da iniciação a síntese de proteínas e alongamento, ao término da fase de tradução requer fatores de proteínas específicas identificadas. Os sinais de terminação da síntese de proteínas são a mesma em ambos os procariotas e eucariotas. Estes sinais são os codões de paragem presente no mRNA. Existem três codões de paragem, UAG, UAA e UGA.
Codões de terminação UAG e UAA são reconhecidos por RF- 1, enquanto que de RF- 2 reconhece terminação codões UAA e UGA. ERF junta-se ao local A do ribossoma relativa ao GTP.
A ligação do ribossoma para a FER peptidotrasferasa estimula a actividade de transferência de grupo peptidilo de água em vez de uma aminoacil- tRNA. O resultado é descarregada ARNt no local P e é ejectado com hidrólise concomitante de GTP. Ribossoma inactivo libera o mRNA e dissocia-se do complexo de 80 em 40 e 60 subunidades, pronto para outro ciclo de tradução.
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